Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMOQ99835 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMOQ99835 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMOQ99835 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMOQ99835 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMOQ99835 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMOQ99835 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMOQ99835 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMOQ99835 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMOQ99835 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMOQ99835 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMOQ99835 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMOQ99835 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMOQ99835 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMOQ99835 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMOQ99835 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMOQ99835 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMOQ99835 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMOQ99835 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMOQ99835 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMOQ99835 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMOQ99835 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMOQ99835 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMOQ99835 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMOQ99835 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMOQ99835 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMOQ99835 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMOQ99835 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMOQ99835 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMOQ99835 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMOQ99835 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMOQ99835 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMOQ99835 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMOQ99835 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMOQ99835 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMOQ99835 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms