Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPA33Q99795 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPA33Q99795 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GPA33Q99795 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms