Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RNF2Q99496 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RNF2Q99496 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms