Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX18Q96RF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX18Q96RF0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms