Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RIPOR3Q96MK2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIPOR3Q96MK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIPOR3Q96MK2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms