Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPM1MQ96MI6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPM1MQ96MI6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPM1MQ96MI6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms