Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SENP8Q96LD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SENP8Q96LD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SENP8Q96LD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms