Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SMIM8Q96KF7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM8Q96KF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms