Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC45A3Q96JT2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC45A3Q96JT2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC45A3Q96JT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms