Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CELF6Q96J87 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CELF6Q96J87 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms