Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSL1Q96IY1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSL1Q96IY1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms