Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3YL1Q96HL8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3YL1Q96HL8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3YL1Q96HL8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms