Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGTBQ96EQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTBQ96EQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTBQ96EQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.6 ms