Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELP4Q96EB1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELP4Q96EB1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms