Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim7Q923T7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim7Q923T7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim7Q923T7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trim7Q923T7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms