Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col20a1Q923P0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col20a1Q923P0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col20a1Q923P0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col20a1Q923P0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col20a1Q923P0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col20a1Q923P0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col20a1Q923P0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col20a1Q923P0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col20a1Q923P0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col20a1Q923P0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms