Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrna2Q91X60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Chrna2Q91X60 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chrna2Q91X60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms