Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPS9Q8WXC6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS9Q8WXC6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPS9Q8WXC6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms