Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX92

NELFB, Negative elongation factor B, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFBQ8WX92 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NELFBQ8WX92 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFBQ8WX92 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFBQ8WX92 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms