Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC13A3Q8WWT9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3Q8WWT9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC13A3Q8WWT9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms