Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKA2Q8WVK7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKA2Q8WVK7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms