Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mark1Q8VHJ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mark1Q8VHJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mark1Q8VHJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms