Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc65Q8VHI7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc65Q8VHI7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc65Q8VHI7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms