Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cabp4Q8VHC5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cabp4Q8VHC5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cabp4Q8VHC5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cabp4Q8VHC5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cabp4Q8VHC5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms