Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg8Q8VE18 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg8Q8VE18 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg8Q8VE18 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms