Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC38A9Q8NBW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A9Q8NBW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A9Q8NBW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms