Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATAD1Q8NBU5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms