Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
LRRC43Q8N309 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC43Q8N309 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC43Q8N309 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms