Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Hecw1Q8K4P8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hecw1Q8K4P8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Hecw1Q8K4P8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms