Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssh3Q8K330 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ssh3Q8K330 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssh3Q8K330 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms