Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shtn1Q8K2Q9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Shtn1Q8K2Q9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shtn1Q8K2Q9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms