Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brd3Q8K2F0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brd3Q8K2F0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms