Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scara5Q8K299 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scara5Q8K299 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scara5Q8K299 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scara5Q8K299 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scara5Q8K299 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scara5Q8K299 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms