Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sde2Q8K1J5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Sde2Q8K1J5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sde2Q8K1J5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sde2Q8K1J5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms