Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a8Q8JZR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc4a8Q8JZR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc4a8Q8JZR6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc4a8Q8JZR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a8Q8JZR6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms