Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP9Q8IXQ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARP9Q8IXQ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARP9Q8IXQ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms