Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph6aQ8CDR2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsph6aQ8CDR2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rsph6aQ8CDR2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph6aQ8CDR2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms