Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Lrrc9Q8CDN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lrrc9Q8CDN9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Lrrc9Q8CDN9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Lrrc9Q8CDN9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lrrc9Q8CDN9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms