Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E4f1Q8CCE9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E4f1Q8CCE9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E4f1Q8CCE9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms