Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB59

Fam161b, Protein FAM161B, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam161bQ8CB59 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam161bQ8CB59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam161bQ8CB59 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam161bQ8CB59 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam161bQ8CB59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam161bQ8CB59 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam161bQ8CB59 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms