Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Spef2Q8C9J3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Spef2Q8C9J3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Spef2Q8C9J3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Spef2Q8C9J3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms