Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sit1Q8C503 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sit1Q8C503 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sit1Q8C503 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms