Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim35Q8C006 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim35Q8C006 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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