Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3aQ8BX90 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3aQ8BX90 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fndc3aQ8BX90 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms