Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Catsper4Q8BVN3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Catsper4Q8BVN3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Catsper4Q8BVN3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms