Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmod1Q8BVA4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmod1Q8BVA4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmod1Q8BVA4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmod1Q8BVA4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms