Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cep55Q8BT07 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cep55Q8BT07 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cep55Q8BT07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep55Q8BT07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms