Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snapc4Q8BP86 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snapc4Q8BP86 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snapc4Q8BP86 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Snapc4Q8BP86 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snapc4Q8BP86 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snapc4Q8BP86 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snapc4Q8BP86 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snapc4Q8BP86 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snapc4Q8BP86 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snapc4Q8BP86 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms