Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem260Q8BMD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem260Q8BMD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem260Q8BMD6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem260Q8BMD6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms