Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW1

Fto, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FtoQ8BGW1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FtoQ8BGW1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FtoQ8BGW1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FtoQ8BGW1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FtoQ8BGW1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms